По идее, если ты не задействуешь что-то, значит движок не рендерит это, а телефон не прорисовывает => никаких проблем быть не должно.
Вероятнее всего, огромное количество функций движка повлияет на вес нашего приложения, но на его стабильность — не должно.
Плюс, вроде можно убрать ненужные вещи в Player Settings, окна Build Settings.