Почему вылезает ошибка при установке clickhouse-mysql-data-reader?

Question

[lexabubu]

Устанавливаю clickhouse-mysql-data-reader и получаю следующую ошибку

Ошибка

[root@CentOS-82-64-minimal ~]# pip3 install -e ./clickhouse-mysql-data-reader/
Obtaining file:///root/clickhouse-mysql-data-reader
Collecting mysqlclient
Using cached mysqlclient-2.0.1.tar.gz (87 kB)
ERROR: Command errored out with exit status 1:
command: /usr/bin/python3.6 -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-2gabu1yg/mysq lclient/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-2gabu1yg/mysqlclient/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'" '"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exe c'"'"'))' egg_info --egg-base /tmp/pip-pip-egg-info-p0u782lt
cwd: /tmp/pip-install-2gabu1yg/mysqlclient/
Complete output (12 lines):
/bin/sh: mysql_config: command not found
/bin/sh: mariadb_config: command not found
/bin/sh: mysql_config: command not found
Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in
File "/tmp/pip-install-2gabu1yg/mysqlclient/setup.py", line 15, in
metadata, options = get_config()
File "/tmp/pip-install-2gabu1yg/mysqlclient/setup_posix.py", line 65, in get_config
libs = mysql_config("libs")
File "/tmp/pip-install-2gabu1yg/mysqlclient/setup_posix.py", line 31, in mysql_config
raise OSError("{} not found".format(_mysql_config_path))
OSError: mysql_config not found
----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

==============================
Подскажите как быть с этим? Мне требуется мигрировать с MySQL на ClickHouse, и к сожалению это является моим барьером((
Пробовал гуглить, но не нашел ответа попробовав кучу методов, теперь прошу помощи у вас!
Спасибо!))

Answer 1

[Владимир Куц]

Нужно предварительно установить сам mysql а также системные библиотеки mysql-клиента.

Comments

[lexabubu]

Владимир, спасибо за ответ!
Но ведь сам mysql у меня установлен на сервере, я собираюсь мигрировать из mysql в clickhouse через python пакет.
Если я установлю его заново, ведь все мои базы послетают?

[Владимир Куц]

lexabubu, какие-то компоненты таки не установлены. Быстрее всего не установлен клиент mysql

[lexabubu]

Владимир Куц, при попытке установить mysqlclient вылазит следующая ошибка

[root@CentOS-82-64-minimal ~]# pip3 install mysqlclient
WARNING: Running pip install with root privileges is generally not a good idea. Try `pip3 install --user` instead.
Collecting mysqlclient
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/a5/e1/e5f2...
Complete output from command python setup.py egg_info:
/bin/sh: mysql_config: command not found
/bin/sh: mariadb_config: command not found
/bin/sh: mysql_config: command not found
Traceback (most recent call last):
File "", line 1, in
File "/tmp/pip-build-xeo1hbi3/mysqlclient/setup.py", line 15, in
metadata, options = get_config()
File "/tmp/pip-build-xeo1hbi3/mysqlclient/setup_posix.py", line 65, in get_config
libs = mysql_config("libs")
File "/tmp/pip-build-xeo1hbi3/mysqlclient/setup_posix.py", line 31, in mysql_config
raise OSError("{} not found".format(_mysql_config_path))
OSError: mysql_config not found

----------------------------------------
Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-xeo1hbi3/mysqlclient/

[Владимир Куц]

Нужно системные библиотеки установить
Что-то вроде
yum install mysql
это не питоновские библиотеки

[lexabubu]

Владимир Куц,
когда я пишу команду rpm -qa | grep -i mysql, то получаю следующее.

[root@CentOS-82-64-minimal ~]# rpm -qa | grep -i mysql
mysql-errmsg-8.0.17-3.module_el8.0.0+181+899d6349.x86_64
mysql-server-8.0.17-3.module_el8.0.0+181+899d6349.x86_64
php-mysqlnd-7.4.10-1.el8.remi.x86_64
mysql-8.0.17-3.module_el8.0.0+181+899d6349.x86_64
php-pecl-mysql-1.0.0-0.23.20190415.d7643af.el8.remi.7.4.x86_64
mysql-common-8.0.17-3.module_el8.0.0+181+899d6349.x86_64

Как я понимаю это говорит о том, что mysql у меня установен(

[Владимир Куц]

lexabubu, в списке помимо всего прочего должно быть что-то вроде

mysql-client
mysql-libs

Этого я у вас в списке не вижу.

[lexabubu]

Владимир Куц, да, в этом и проблема что mysql-client'а нету, но при попытке его установить я получаю то что написано в третьем комментарии ( там я и пытаюсь собственно установить mysqlclient

[Владимир Куц]

lexabubu, так вы пытаетесь установить библиотеку в среде python в комменте.
Я вам еще раз повторяю - библиотеку нужно установить системную. Python пока тут не при чем

[lexabubu]

Владимир Куц, sudo yum install python3-devel mysql-devel
вот это команда позволила решить мою проблему.
Она установила все библиотеки
Спасибо что были со мной! лайк!)