Почему это не подходит?
По ssh можно зайти на сервер и работать локально с mysql, либо через туннель пробросить порт и коннектиться например через воркбенч.
Александр Шабельский, не подходит из-за дополнительных накладных расходов на передачу данных по безопасному каналу и задержек сети, особенно если через интернет. Но если сильно хочется, то никто не запрещает.