Кого, куда и по сколько:
const itemSelector = 'здесь должен селектор элементов, которые надо переместить';
const containerSelector = 'а здесь - селектор контейнеров';
const chunkSize = 3;
Перемещаем:
const $items = $(itemSelector);
$(containerSelector).append(i => $items.slice(i * chunkSize, (i + 1) * chunkSize));
// или
const $containers = $(containerSelector);
$(itemSelector).each((i, n) => $containers.eq(Math.floor(i / chunkSize)).append(n));
или
document.querySelectorAll(containerSelector).forEach(function(n, i) {
n.append(...this.slice(i * chunkSize, -~i * chunkSize));
}, [...document.querySelectorAll(itemSelector)]);
// или
const containers = document.querySelectorAll(containerSelector);
for (const [ i, n ] of document.querySelectorAll(itemSelector).entries()) {
containers[i / chunkSize | 0]?.appendChild(n);
}