add_filter( 'woocommerce_cart_calculate_fees', 'add_my_fee', 10, 1 );
function add_my_fee() {
$gateway = WC()->session->get( 'chosen_payment_method' );
if ( $gateway == 'paypal' ) {
WC()->cart->add_fee( 'Наценка за метод оплаты который нам не нравится', 100 );
}
}