С магенто не сталкивался никогда, но, думаю, принцип тут точно такой же, как и с абсолютно любым ИМ:
- Экспорт из исходного ИМа информации по товарам в файл
- Импорт товаров в новый ИМ из файла
Достаточно кэповский ответ, но так и есть. Если нет готового модуля в маркетплейсе битрикса (а его нет, я глянул), то скрипт переноса придётся писать самому.
Можно и не через файл переносить, а через REST, например. Но так или иначе придётся кодить)