Чисто теоретически - есть такая структура html- внутри флекс-контейнера несколько списков, разной высоты.
В конец каждого из имеющихся списков надо добавить по одной ссылке, чтобы пустоты не оставались, т.е. "прилепить" сслыки к спискам. При этом возможности сделать это внутри контейнера нет, так как нельзя изменить html структуру dom. Стилизовать можно как угодно, но конечно не подбирать отрицательный margin-top по каждой конкретной ссылке.
Для лучшего понимания картинка и песочница.