Никак. Делай скрин всего экрана, отображай на весь экран поверх всех окон, тыкай мышкой в любой точке на картинке, получай координаты, получай цвет пикселя на картинке по заданным координатам.
Шохрух Шаймардонов, нет не может. Сначала захватывается весь экран и с получившейся картинки выбирается цвет пикселя. Тут этим занимается сторонняя библиотека.