В принципе
@DOC_tr прав, но:
1. Запускать php от root не надо. Вообще не надо.
Если вы имеете ввиду что вроде - запускаем скрипт, он просит ввести судовский пароль и выполняем команду, то так сделать нельзя
2. Так сделать можно. Ключи -A, --askpass
system('SUDO_ASKPASS=/path/to/askpass/askpass sudo -A whoami');
#!/usr/bin/env bash
#/path/to/askpass/askpass
echo "Pa$$word"
про askpass-A, --askpass
Normally, if sudo requires a password, it will read it from the user's terminal. If the -A (askpass) option is specified, a (possibly graphical) helper program is executed to
read the user's password and output the password to the standard output. If the SUDO_ASKPASS environment variable is set, it specifies the path to the helper program. Other‐
wise, if sudo.conf(5) contains a line specifying the askpass program, that value will be used. For example:
# Path to askpass helper program
Path askpass /usr/X11R6/bin/ssh-askpass
If no askpass program is available, sudo will exit with an error.
3. Можно разрешить запускать скрипт без пароля (NOPASSWD).