Ctr это количество показов к количеству кликов в данной ситуации. Вам нужно скорее всего клики по баннерам отслеживать. По крайней мере я бы так сделал.
Но тебе придется или вешать айдишники на фреймы, что может быть не очень если баннеров много. Либо брать атрибуты src и как-то это все передавать в метрику