В 1Се сделать специальную обработку, чтобы формировала один или несколько файлов с товарами, остатками, ценами и выгружала их на сайт. В обратную сторону можно забирать с сайта заказы покупателей и превращать их в документы. При необходимости, можно запускать такой обмен по расписанию в полностью автоматическом режиме.