Использовать очень просто, вставляешь маленький кусок кода в свой проект и далее идёшь смотреть на сайт nodetime. Там есть множество параметров на любой вкус. Nodetime может много что мониторить, он сам находит используешь ли ты БД, редис, хттп запросы и мониторит их.
Так же он мониторит системные параметры (цпу, load average, ...) и позволяет делать срезы памяти приложения.
В общем, для начала нужно определиться что тебе вообще мониторить нужно.