Разобрался.
Ошибка была в следующем:
1. Стили подгружались так 'styles/style.css'
2. А подключение статики было так: app.use(express.static('resources'))
Решение:
1. Стили так: '/static/styles/etc.css'
2. Статику так: 'app.use('/static', express.static(__dirname + 'resources', {fallthrough: false}))'
Причина:
Как я понял стили подтягивались по адресу сразу после первого /, поэтому некорректно подгружались. С указанием конкретной папки это проблема ушла.