1. Вариант
Ищите и убирайте во всех контроллерах, где нужно убарть resize:
$this->model_tool_image->resize
2. Вариант
Поправьте логику ресайза в system/library/image.php
Если я не ошибаюсь, вам будет достаточно заменить:
$this->image = imagecreatetruecolor($width, $height);
на
$this->image = imagecreatetruecolor($new_width, $new_height);
Тогда он просто отскейлит картинку до нужных размеров по одной из сторон. Потестите и подправьте под себе.
2 вариант предпочтительней. Т.к. совсем не ресайзить картинки плохая идея. У вас будут очень тяжелые страницы категорий и т.д.