Укажите RuntimeIdentifier или присвойте свойству SelfContained значение "false".
https://docs.microsoft.com/ru-ru/dotnet/core/deplo...
Visual Studio создает отдельный профиль публикации (*.pubxml) для каждой целевой платформы. Например, файл для профиля linux (linux.pubxml) выглядит следующим образом:
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<!--
https://go.microsoft.com/fwlink/?LinkID=208121.
-->
<Project ToolsVersion="4.0" xmlns="http://schemas.microsoft.com/developer/msbuild/2003">
<PropertyGroup>
<PublishProtocol>FileSystem</PublishProtocol>
<Configuration>Release</Configuration>
<Platform>Any CPU</Platform>
<TargetFramework>netcoreapp2.1</TargetFramework>
<PublishDir>bin\Release\netcoreapp2.1\publish\linux</PublishDir>
<RuntimeIdentifier>win-x86</RuntimeIdentifier>
<SelfContained>true</SelfContained>
<_IsPortable>false</_IsPortable>
</PropertyGroup>
</Project>
Откройте у себя такой файл и посмотрите что указано в
<RuntimeIdentifier>win-x86</RuntimeIdentifier>
, доступные варианты идентификаторов тут
https://docs.microsoft.com/en-us/dotnet/core/rid-c...