Самый простой и удобный способ, если изменений много или они не простые.
Качаем бесплатный
dotpeek.
Открываем в нем dll или exe как проект (будут сгенерированы файлы проекта).
Редактируем и компилируем снова, но уже с внесенными изменениями.
Если хочется без перекомпила, то тут много других утилит, названия забыл уже, но их много.