В линукс программы не устанавливаються в отдельные папки. Все бинарники идут в /usr/bin, библиотеки в /usr/lib, ресурсы в /usr/share, etc.
Обычно это делает пакетный менеджер автоматически.
При установке не через пакетный менеджер обычно устанавливают в /usr/local/bin, /usr/local/lib, etc.
Попадаются разработчики, которые не смогли освоить
FHS и кидают всё в одну папку. Тогда она обчно устанавливаеться в /opt (/opt/clion, /opt/sublime_text_3, etc).