1) можно поюзать
https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/API/M... - если не нужны старые IE (если нужны - для 9-10 можно подпереть вот этим
https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/API/M... )
2) можно пропатчить либу (и заслать MR, если либа живая)
3) самый тупой и рабочий способ, который советовали в комментах и который я бы скорее всего и взял - проверять присутствие элемента через интервал / requestAnimationFrame
4) есть совсем злое решение: переопределить node.parentNode.removeChild, добавив туда ваш колбек - только никому не показывайте =)