Где элементы находятся, о каких классах идёт речь и что надо сделать с элементами:
const container = document.querySelector('div');
const exclude = [ 'class1', 'class2', 'class3' ];
const process = el => el.style.display = 'none';
Хватаем все элементы, выполняем фильтрацию:
Array
.from(container.children)
.filter(n => !exclude.some(m => n.classList.contains(m)))
.forEach(process);
Или, собираем селектор, соответствующий только тем элементам, которые нужны:
container
.querySelectorAll(`:scope > :not(${exclude.map(n => `.${n}`)})`)
.forEach(process);
