О каком input'е идёт речь, и чему должно быть кратно его значение:
const input = document.querySelector('input');
const num = 100;
Можно исправлять вводимые значения:
input.addEventListener('change', function() {
this.value = (this.value / num | 0) * num;
});
Или не давать вводить неправильные - блокируем ввод в инпут (атрибут readonly), изменение значения осуществляем с помощью кнопок:
<button data-step="-1">-</button>
<button data-step="+1">+</button>
document.querySelectorAll('[data-step]').forEach(function(n) {
n.addEventListener('click', this);
}, e => input.value = +input.value + e.target.dataset.step * num);