Как понимаю, эти модели и текстуры можно через установленный аддон открывать в Блендере.
Можно написать на Питоне скрипт к Блендеру, который будет открывать модели/текстуры и экспортировать их в нужный формат. Потом запускать Блендер с этим скриптом автоматически из консоли в безоконном режиме.