Защита от кеширования.
Например, JS файл генерироуется динамически каждый раз. Нужно, чтобы он не кешировался браузером, а каждый раз загружался с сервера.
Управление кешированием браузера. Для каждой версии скрипта это число будет уникальным, поэтому при одной версии браузер будет использовать кеш, а при изменении версии - обновит скрипт
Скрипт генерируется на сервере, и это число там для чего-то используется
