Фактически разница в основном в лицензировании. IoT рассчитана на установку во встраиваемые решения и различные промышленные ПК (Платежные терминалы, кассы, инфоматы и прочее), и политика распространения схожа с OEM-лицензиями "Покупаешь больше - платишь меньше, но кроме этой железки нигде использовать не можешь".
В розничной продаже IoT не попадается, закупка только через представительства MS, с индивидуальными условиями и лицензиями.
Вообще IoT это то, что раньше называлось Embedded или POS-Ready, и конфигурация ОС определяется при закупке и не требует активации каждой копии индивидуально.