Причем здесь themeforest?
1) Как быть со стилями? Использую элементы бутстрап и для них уже написаны стили в bootstrap.min.css. Мне надо полностью изменить внешний вид элемента. Куда писать стили? В свой style.css? Если так, то зачем так делать? Получается будет лишний код в bootstrape.min.css.
Да писать в свой и подключать позже основы.
Если речь про
купленную тему с themeforest, то в комплекте всегда идут исходники и скрипты для сборки.
И даже psd шаблона.
2) Обязательно ли должен быть подключён bootstrap.min.js, если я не использую скрипты бутстрапа (не использую табы, меню, аккордеоны и т.д).
А что вы тогда используете? Там даже самые простые действия завязаны на JS.
Откройте например на мобильном, если меню скукоживается в иконку - значит он нужен, иначе оно не будет разворачиваться.
Простой
Простой