У каждого из инструментов есть свови плюсы.
HTACCESS
+ "ожидаемое" место для таких вещей, и SEOшник полезет туда в их поиске.
+ Есть много готовых пресетов и гернраторов для правил.
- Странное поведение редиректов ( нужно хорошо знать mod_rewrite чтобы понимать что и почему происходит)
- не работает на nginx и iis
- трудность создания редиректов с гет параметрами.
- большое количество редиректов снижает производительность сайта ( Но на практике не заметно)
php
+ нет проблем с редиректами GET параметров
+ нет последовательности кодов типа 301 +301 +301+200
+ можно сделать редирект типа сделать 301 если текущий статус урла 404 да и вообще можно положить в
404.php ( в .htaccess тоже можно но через ...)
+ сработает на любом веб сервере
-нестандартное место и искать их никто не будет
-seo шник не знает php