Если процессы с загруженной dll разные, то вы не должны беспокоиться о памяти - она будет разная в разных процессах.
Но могут быть другие нюансы, например использование одного и того же порта для сокета или открытие глобальных именованных каналов с заданным именем и т.п. В этом случае либо второй и т.д. процессы будут вываливаться с ошибками, либо возможны разные трудно диагностируемые проблемы.