Так же как вы входите в систему.
По умолчанию в битрикс ВМ нет ftp сервера но его с легкостью заменяет sftp
По сути вам нужно указать все настройки юзеара от которого вы подключаетесь, и да чтобы небыло проблем с правами на файл используйте юзера bitrix.
Которому вы создавали отдельный пароль при создание сервера. Кстати пароль для него можно скинуть через админку.
ТАк же можно поставить фтп сервер, он ставится достаточно легко и так же будет работать от этогоюзера.