Во первых, можно добавить в composer.json:
"config": {
"bin-dir": "bin"
}
Тогда в папке bin в корне проекта будут создаваться симлинки для всех консольных пакетов.
Во вторых, нужно создать в корне файл с конфигом phpunit.xml, который может выглядеть примерно так:
<phpunit bootstrap="vendor/autoload.php">
<testsuites>
<testsuite name="Unit test">
<directory>tests</directory>
</testsuite>
</testsuites>
</phpunit>
И в нём уже описать подробно настройки. Тогда при выполнении
bin/phpunit будут запускаться тесты с указанными в конфиге настройками.
