Если Вы знали, что на бэкенде хотят бустрап, то при верстке Вы должны были это учесть, соответственно учесть как именовать свои классы. А так просто прихотью Вы создаете проблемы, которые могут привести к увеличению стоимости продукта. Радости работодатель от этого не испытает.
Хороший исполнитель тот, который реализует все пожелания, тем более ему за это платят.
Поэтому добавьте бустрап и переименуйте классы, чтобы не было конфликтов имен.