Можете вот эту либу подключить: https://github.com/matthewhudson/device.js
При запуске посмотреть через нее какое у вас устройство и в зависимости от этого использовать fullpage или нет.
Martovitskiy, Еще убедитесь, что VueFullpage.destroy('all') это валидный вызов, из документации это не очевидно. И может вообще подумать над тем, если ли смысл добавлять плагин, а потом его убивать, может нужно сначала делать проверку, и на ее основании регистрировать или нет плагин.