Посмотрите пожалуйста мой код, все подключаемые файлы проверял через инструменты разработчика, все нормально прикручено.
<!DOCTYPE html>
<html lang="en">
<head>
<meta charset="UTF-8">
<title>upload</title>
<link rel="stylesheet" href="formstone/css/upload.css">
</head>
<body>
<script
src="http://code.jquery.com/jquery-1.12.4.min.js"
integrity="sha256-ZosEbRLbNQzLpnKIkEdrPv7lOy9C27hHQ+Xp8a4MxAQ="
crossorigin="anonymous"></script>
<script src="formstone/js/core.js"></script>
<script src="formstone/js/upload.js"></script>
<script>
$('document').ready(function(){
$(".uploads").upload({
});
});
</script>
<div class="wrap" style="background: #fff;padding:30px">
<h1>Пример Upload</h1>
<div class="uploads"></div>
<div class="res"></div>
</div>
</body>
</html>