каким браузером вы пользуетесь? Firefox почему-то не всегда работает с этим плагином
в CKEditor есть разные виды paste и разные кнопки для них, в конфигурации нужно выбрать ту, которая вставляет без форматирования
если вам нужно чтобы правильно отображалось в самом окне CKEditor, то для него надо прописать еще и CSS стили