Нужно понимать структуру организации шаблона.
1.
Создать шаблон с "нуля" - САМЫЙ базовый: всего 3 файла!
2. Оф. документация по созданию шаблона Joomla:
здесь
3. Также, можно править стиль уже готового шаблона.
Пример как раз на Protostar:
здесь
4. Protostar - полное руководство по кастомизации:
здесь