1000 процессов ноды через стандартный
https://nodejs.org/dist/latest-v8.x/docs/api/clust... не взлетят, упадет на ~150 форке, надо думать. Например запускать 10 ботов в одном процессе или вот статья на хабре была интересная:
https://habrahabr.ru/post/334986/ , и запустить 32 корневых процесса через неё, в каждом из которых будет автоматическое количество нужных ботов.
Также в pm2 есть какие-то средства кластеризации.