Мало данных, почему 5 дней? каково состояние таблиц на момент запросов? какое количество соединений задействовано/выставлено в настройках? лок таблицы при инсертах включен в скрипте вставки? И еще куча нюансов может быть.
ПС: Я бы начал с объяснения первого пункта.