Вам необходимо настроить vlan На самом mikrotik и условно сделать привязку к нужным вам интерфейсам.
Так как по сути у вас нет выделенного wan порта, первый порт можете добавить к masterport 2. (он по умолчанию master)
interface>ether-1>master port
Потом вам надо будет в чипе коммутации (switch) создать и привязать нудные vlan, очень неплохо это описывается и рассказывается тут:
https://14bytes.ru/mikrotik-nastraivaem-vlan-trunk...
Вам надо будет принять маркированный трафик на ether1 , присвоить его ether2/3 в не маркерованном (растегированным виде) На компах уже настраиваете ip которые выдал провайдер.
Вот тут еще один интересный пример для понимания
https://habrahabr.ru/post/313702/
и да, делать лучше все через switch, так как это разгрузит CPU.
Будут вопросы задавайте.