Проблема с вашим дейтпикером лежит в этой строчке
document.getElementsByTagName("body").item(0).appendChild(e_cal);
tcall.js 168 строка, если верить дебаг-консоли хрома
То есть получая координаты элемента, по которому сработало событие click, контейнер дейтпикера аппендится к body, имея координаты х и y при display: absolute. Из-за того, что у родительской обёртки section, в котором лежат кнопки дейтпикера, свойство position изменяется на fixed, то вот этот код получения координат
var n_left = f_getPosition (this, 'Left'),
n_top = f_getPosition (this, 'Top') + this.offsetHeight;
отсчитывает их НЕ от верха страницы, как это делалось до изменения position, а от верха родительского section, что равняется top: 343px; left: 426px;. И координаты то эти правильны, если отображать его относительно родительского section, но совершенно не верны из-за того, куда аппендится сам дейтпикер.
Теперь вам необходимо переписать функцию отрисовки дейтпикера так, что бы он цеплялся ниже блока с иконкой календарика. Это позволит оставаться ему на нужном месте, даже если пользователь кликнет по календарю и не закрыв его начнёт скролить страницу.