Здесь ответ на ваш вопрос.
Для тех, кто не знает английский.
Версию сервера нужно выбирать в зависимости от того, как вы интегрируете PHP c веб-сервером.
Например, когда вы используете mod_php, у вас модуль и PHP всегда загружены в память и каждый запрос обрабатывается в отдельном потоке. Из-за этого mod_php работает быстрее, чем CGI. В данном случае нужно использовать потоко-безопасную реализацию (thread-safe) поскольку каждый поток имеет доступ к памяти другого потока.
Когда вы работаете с IIS, у вас PHP запускается ввиде отдельного процесса через CGI и в таком случае потоко-безопасность не имеет смысла, поскольку у вас 1 процесс и фактически 1 поток созданный этим же процессом. Операционная система изолирует память процессов по умолчанию.
В случае модели с FastCGI, потокобезопасность также не имеет смысла, поскольку тотже PHP-FPM держит несколько отдельных процессов PHP в памяти, но не потоков.