Странно, что вы абсолютно точно хотите начать с определенной книги, но в тоже время вы не знаете чем отличается одно издание этой книги, от другого...
По какому критерию вы определились, что хотите начать именно с Фленагана?
Одно могу сказать теперь. Читайте все подряд и все. Практически все книги для по JS, для людей которые вообще не знакомы с языком, будут одинаково полезны. Вам все равно из какой книги вы получите общее представление о языке.
Просто берите более менее актуальную книгу (ES5+) и читайте ее.
Также хочу отметить, что в отличие от всех книг (на русском и не считая head first), только в одной есть достаточно большое количество задач для закрепления пройденной темы. Это учебник Ильи Кантора.
Издания Флэнагана отличаются годом выпуска и соответственно версией стандарта про который говорится в книге. Соответственно нужно брать самый последний.
Другой вопрос нужно ли? Про стандарты ES2015 и далее у Флэнагана нет. И он не планирует выпускать новые издания.
Конечно, нужно брать самое новое издание. Но, как сказали выше, Флэнаган сложен, для новичков он вообще может быть вреден, потому что там темы раскрываются по спирали и сначала много чего будет непонятно. К примеру, про методы говорится уже там, где говорится про строки, и везде добавления о том, что "эта тема будет подробно раскрываться через 10 глав"
