Добрый вечер, почему у куба меняется ось вращения? Мне кажется дело в обёртке
cube-container, которая является сечением куба и это сечение нужно расположить так, чтобы оно проходило через верхний и нижний угол
(Рис. 1).
На втором рисунке куб смещается относительно оси.
https://jsfiddle.net/11wkmcbw/