Потому что методы jquery работают, только с объектом jquery. Т.е. прибавлять класс нужно так, как вы указали в описании
$(".myClass").addClass('someClass');.
$(".myClass") - это jquery объект, только с ним jquery и может работать.
В вашем же случае нужно написать так:
var buttonsWrapper = $("<div />", {
'class': 'buttons'
});
Переменная будет хранить созданный
div с указанным классом
buttons