Да вроде все системы контроля версий умеют (или настраиваются), и при попытке посмотреть изменения между двумя версиями документа MS WORD автоматически открывают два варианта документа в Ворде же с его внутренним механизмом сравнения документов.
Так, во всяком случае, работает TоrtoiseSvn сразу "из коробки".