Знак никак не может опускаться. 64 бита -- это 64 бита. И как их представлять -- проблема конкретной задачи, а не числа.
За знак обычно отвечает самый старший бит. Если его интерпретировать не как флаг, а как участника разрядности числа, то у вас будет беззнаковое число, диапазоном от 0 до 2^64. Если его учитывать как бит знаковости, то можно получить диапазон от -2^63 (старший бит в единице) до 2^63-1 (старший бит в нуле).
Как его интерпретировать зависит только от того, какой тип вы выберете при чтении: signed long long или unsigned long long.