При адаптации под мобильные устройства удобнее использовать padding и margin от контента (логотипы, телефоны, кнопки), так как при перестройке не придется переопределять расстояния.
А если верстается страница без мобильной версии (иногда так бывает), то вполне можно сделать и min-height.
В общем, всё зависит от задачи, трудно ответить просто так)