Чтобы записать имя файла в базу нужно сначала научиться работать с базой данных (подключение и выполнение запросов), определиться с типом базой данных (реляционная или nosql), подключить работу с базой в скрипт, и да, храним не оригинальные имена файлов, а их хэши.