Затруднение вызвала эта строчка 
scrollTop: $(hash).offset().top
Насколько я понимаю, hash - это значение аттрибута href у ссылки. Как у аттрибута могут быть координаты? 
Дальше есть строчка 
window.location.hash = hash, которая так же подразумевает что hash - это аттрибут. 
В чем моя ошибка? 
P.S. Почему-то не вижу разницы, что с этим кодом, что без. 
Код целиком, на всякий случай. 
$(document).ready(function(){
  // Add scrollspy to <body>
  $('body').scrollspy({target: ".navbar", offset: 50});
  // Add smooth scrolling on all links inside the navbar
  $("#myNavbar a").on('click', function(event) {
    // Make sure this.hash has a value before overriding default behavior
    if (this.hash !== "") {
      // Prevent default anchor click behavior
      event.preventDefault();
      // Store hash 
      var hash = this.hash;
      // Using jQuery's animate() method to add smooth page scroll
      // The optional number (800) specifies the number of milliseconds it takes to scroll to the specified area
      $('html, body').animate({
        scrollTop: $(hash).offset().top
      }, 800, function(){
   
        // Add hash (#) to URL when done scrolling (default click behavior)
        window.location.hash = hash;
      });
    }  // End if
  });
});