Поставить (если еще не установлен) msysgit, клиентом ssh для него выбрать putty (plink), в настройках репозитория выбрать подключаемый ppk-ключик, поставить галочку подгружать автоматически, и начинать пользоваться. Теперь при установке соединения будет подгружатся клиент аутентификации pageant, который будет этот ключик подхватывать. Замутил бы гайд со скринами, но сейчас нахожусь не дома.
