"Перестройка" будет при любом создании/удалении элементов DOM, потери слушателей тоже нельзя избежать при создании нового элемента взамен старого, в любом случае надо переносить их вручную скриптом.
Задачи очень разные, может вы вообще новый контейнер создаете, а может нужно в старом изменить всего лишь один атрибут всего одного элемента, разумеется действовать надо по-разному.
Все ли это остается так же актуальным и в 2016?
Зачем задавать такой вопрос, не проще ли самому попробовать, вас что, забанили там, где новые версии браузеров скачивают? И на caniuse, htmlbook и т.п. тоже забанили? Похоже, вы просто не понимаете, о чем говорите, вас интересует не как следует делать, а как одобряется сообществом. К сожалению, будучи частью социума приходится практиковать и второе, как говорится "для галочки", чтобы проходить собеседования и т.п., но, с другой стороны, если начальник будет разумным человеком, то его не устроят ваши мнения без понимания, а глупые начальники живут не очень долго, ровно столько сколько они заработали когда они или их предшественники были умными.
