Да, накопленный CTR имеет большое значение. Особенно, если он такой высокий, как Вы пишете.
Также, если действительно объявления, целевые ссылки (не только домен) и запросы сохранились те же, то может ещё влиять и время суток, когда Вы замеряете стоимость клика — она будет меняться постоянно в течение дня. Кроме того, до запуска в интерфейсе могут отображаться несколько завышенные ставки, которые могут снизиться после старта кампаний. Поэтому советую сравнивать среднюю стоимость клика кампаний из нового аккаунта со старым. И если она будет выше, значит, да — это CTR, ждите около 4 недель.