Речь идет конкретно о библиотеке three.js, но так как шансов что ей кто-то пользуется очень мал, буду рад ответу основанного на опыте других 3D библиотек.
А вопрос в том, как применить эффект на всю сцену-камеру? То есть я написал шейдер, который меняет цвет, как его применить ко всему экрану?
